Golub-Kahan SVD algorithm for KMP tensors #499
@ -17,6 +17,7 @@ import space.kscience.kmath.tensors.core.DoubleTensor
|
|||||||
import space.kscience.kmath.tensors.core.DoubleTensorAlgebra
|
import space.kscience.kmath.tensors.core.DoubleTensorAlgebra
|
||||||
import space.kscience.kmath.tensors.core.IntTensor
|
import space.kscience.kmath.tensors.core.IntTensor
|
||||||
import kotlin.math.abs
|
import kotlin.math.abs
|
||||||
|
import kotlin.math.max
|
||||||
import kotlin.math.min
|
import kotlin.math.min
|
||||||
import kotlin.math.sqrt
|
import kotlin.math.sqrt
|
||||||
|
|
||||||
@ -349,3 +350,298 @@ internal fun DoubleTensorAlgebra.svdHelper(
|
|||||||
matrixV.mutableBuffer.array()[matrixV.bufferStart + i] = vBuffer[i]
|
matrixV.mutableBuffer.array()[matrixV.bufferStart + i] = vBuffer[i]
|
||||||
}
|
}
|
||||||
}
|
}
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||||||
|
|
||||||
|
internal fun pythag(a: Double, b: Double): Double {
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||||||
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val at: Double = abs(a)
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||||||
|
val bt: Double = abs(b)
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||||||
|
val ct: Double
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||||||
|
val result: Double
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||||||
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if (at > bt) {
|
||||||
|
ct = bt / at
|
||||||
|
result = at * sqrt(1.0 + ct * ct)
|
||||||
|
} else if (bt > 0.0) {
|
||||||
|
ct = at / bt
|
||||||
|
result = bt * sqrt(1.0 + ct * ct)
|
||||||
|
} else result = 0.0
|
||||||
|
return result
|
||||||
|
}
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||||||
|
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||||||
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internal fun SIGN(a: Double, b: Double): Double {
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||||||
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if (b >= 0.0)
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return abs(a)
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||||||
|
else
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||||||
|
return -abs(a)
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||||||
|
}
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|
internal fun MutableStructure2D<Double>.svdGolabKahanHelper(u: MutableStructure2D<Double>, w: BufferedTensor<Double>, v: MutableStructure2D<Double>) {
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val shape = this.shape
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||||||
|
val m = shape.component1()
|
||||||
|
val n = shape.component2()
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||||||
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var f = 0.0
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||||||
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val rv1 = DoubleArray(n)
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||||||
|
var s = 0.0
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||||||
|
var scale = 0.0
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||||||
|
var anorm = 0.0
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||||||
|
var g = 0.0
|
||||||
|
var l = 0
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||||||
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val epsilon = 1e-10
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||||||
|
for (i in 0 until n) {
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||||||
|
/* left-hand reduction */
|
||||||
|
l = i + 1
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||||||
|
rv1[i] = scale * g
|
||||||
|
g = 0.0
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
scale = 0.0
|
||||||
|
if (i < m) {
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
scale += abs(this[k, i]);
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||||||
|
}
|
||||||
|
if (abs(scale) > epsilon) {
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
this[k, i] = (this[k, i] / scale)
|
||||||
|
s += this[k, i] * this[k, i]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
f = this[i, i]
|
||||||
|
if (f >= 0) {
|
||||||
|
g = (-1) * abs(sqrt(s))
|
||||||
|
} else {
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||||||
|
g = abs(sqrt(s))
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||||||
|
}
|
||||||
|
val h = f * g - s
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||||||
|
this[i, i] = f - g
|
||||||
|
if (i != n - 1) {
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
s += this[k, i] * this[k, j]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
f = s / h
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
this[k, j] += f * this[k, i]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
this[k, i] = this[k, i] * scale
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + i] = scale * g
|
||||||
|
/* right-hand reduction */
|
||||||
|
g = 0.0
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
scale = 0.0
|
||||||
|
if (i < m && i != n - 1) {
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
scale += abs(this[i, k])
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if (abs(scale) > epsilon) {
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
this[i, k] = this[i, k] / scale
|
||||||
|
s += this[i, k] * this[i, k]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
f = this[i, l]
|
||||||
|
if (f >= 0) {
|
||||||
|
g = (-1) * abs(sqrt(s))
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||||||
|
} else {
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||||||
|
g = abs(sqrt(s))
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||||||
|
}
|
||||||
|
val h = f * g - s
|
||||||
|
this[i, l] = f - g
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
rv1[k] = this[i, k] / h
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||||||
|
}
|
||||||
|
if (i != m - 1) {
|
||||||
|
for (j in l until m) {
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
s += this[j, k] * this[i, k]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
this[j, k] += s * rv1[k]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (k in l until n) {
|
||||||
|
this[i, k] = this[i, k] * scale
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
anorm = max(anorm, (abs(w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + i]) + abs(rv1[i])));
|
||||||
|
}
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||||||
|
|
||||||
|
for (i in n - 1 downTo 0) {
|
||||||
|
if (i < n - 1) {
|
||||||
|
if (abs(g) > epsilon) {
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
v[j, i] = (this[i, j] / this[i, l]) / g
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
for (k in l until n)
|
||||||
|
s += this[i, k] * v[k, j]
|
||||||
|
for (k in l until n)
|
||||||
|
v[k, j] += s * v[k, i]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
v[i, j] = 0.0
|
||||||
|
v[j, i] = 0.0
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
v[i, i] = 1.0
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||||||
|
g = rv1[i]
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||||||
|
l = i
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|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
for (i in min(n, m) - 1 downTo 0) {
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||||||
|
l = i + 1
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||||||
|
g = w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + i]
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
this[i, j] = 0.0
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if (abs(g) > epsilon) {
|
||||||
|
g = 1.0 / g
|
||||||
|
for (j in l until n) {
|
||||||
|
s = 0.0
|
||||||
|
for (k in l until m) {
|
||||||
|
s += this[k, i] * this[k, j]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
f = (s / this[i, i]) * g
|
||||||
|
for (k in i until m) {
|
||||||
|
this[k, j] += f * this[k, i]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
for (j in i until m) {
|
||||||
|
this[j, i] *= g
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
for (j in i until m) {
|
||||||
|
this[j, i] = 0.0
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
this[i, i] += 1.0
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
var flag = 0
|
||||||
|
var nm = 0
|
||||||
|
var c = 0.0
|
||||||
|
var h = 0.0
|
||||||
|
var y = 0.0
|
||||||
|
var z = 0.0
|
||||||
|
var x = 0.0
|
||||||
|
for (k in n - 1 downTo 0) {
|
||||||
|
for (its in 1 until 30) {
|
||||||
|
flag = 1
|
||||||
|
for (newl in k downTo 0) {
|
||||||
|
nm = newl - 1
|
||||||
|
if (abs(rv1[newl]) + anorm == anorm) {
|
||||||
|
flag = 0
|
||||||
|
l = newl
|
||||||
|
break
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if (abs(w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + nm]) + anorm == anorm) {
|
||||||
|
l = newl
|
||||||
|
break
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
if (flag != 0) {
|
||||||
|
c = 0.0
|
||||||
|
s = 1.0
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||||||
|
for (i in l until k) {
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||||||
|
f = s * rv1[i]
|
||||||
|
rv1[i] = c * rv1[i]
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||||||
|
if (abs(f) + anorm == anorm) {
|
||||||
|
break
|
||||||
|
}
|
||||||
|
h = pythag(f, g)
|
||||||
|
w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + i] = h
|
||||||
|
h = 1.0 / h
|
||||||
|
c = g * h
|
||||||
|
s = (-f) * h
|
||||||
|
for (j in 0 until m) {
|
||||||
|
y = this[j, nm]
|
||||||
|
z = this[j, i]
|
||||||
|
this[j, nm] = y * c + z * s
|
||||||
|
this[j, i] = z * c - y * s
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
z = w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + k]
|
||||||
|
if (l == k) {
|
||||||
|
if (z < 0.0) {
|
||||||
|
w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + k] = -z
|
||||||
|
for (j in 0 until n)
|
||||||
|
v[j, k] = -v[j, k]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
break
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
// надо придумать, что сделать - выкинуть ошибку?
|
||||||
|
// if (its == 30) {
|
||||||
|
// return
|
||||||
|
// }
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||||||
|
|
||||||
|
x = w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + l]
|
||||||
|
nm = k - 1
|
||||||
|
y = w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + nm]
|
||||||
|
g = rv1[nm]
|
||||||
|
h = rv1[k]
|
||||||
|
f = ((y - z) * (y + z) + (g - h) * (g + h)) / (2.0 * h * y)
|
||||||
|
g = pythag(f, 1.0)
|
||||||
|
f = ((x - z) * (x + z) + h * ((y / (f + SIGN(g, f))) - h)) / x
|
||||||
|
c = 1.0
|
||||||
|
s = 1.0
|
||||||
|
|
||||||
|
var i = 0
|
||||||
|
for (j in l until nm + 1) {
|
||||||
|
i = j + 1
|
||||||
|
g = rv1[i]
|
||||||
|
y = w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + i]
|
||||||
|
h = s * g
|
||||||
|
g = c * g
|
||||||
|
z = pythag(f, h)
|
||||||
|
rv1[j] = z
|
||||||
|
c = f / z
|
||||||
|
s = h / z
|
||||||
|
f = x * c + g * s
|
||||||
|
g = g * c - x * s
|
||||||
|
h = y * s
|
||||||
|
y *= c
|
||||||
|
|
||||||
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for (jj in 0 until n) {
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||||||
|
x = v[jj, j];
|
||||||
|
z = v[jj, i];
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||||||
|
v[jj, j] = x * c + z * s;
|
||||||
|
v[jj, i] = z * c - x * s;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
z = pythag(f, h)
|
||||||
|
w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + j] = z
|
||||||
|
if (abs(z) > epsilon) {
|
||||||
|
z = 1.0 / z
|
||||||
|
c = f * z
|
||||||
|
s = h * z
|
||||||
|
}
|
||||||
|
f = c * g + s * y
|
||||||
|
x = c * y - s * g
|
||||||
|
for (jj in 0 until m) {
|
||||||
|
y = this[jj, j]
|
||||||
|
z = this[jj, i]
|
||||||
|
this[jj, j] = y * c + z * s
|
||||||
|
this[jj, i] = z * c - y * s
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
rv1[l] = 0.0
|
||||||
|
rv1[k] = f
|
||||||
|
w.mutableBuffer.array()[w.bufferStart + k] = x
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
for (i in 0 until m) {
|
||||||
|
for (j in 0 until n) {
|
||||||
|
u[j, i] = this[i, j]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
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