Add Gorbachev.md.

.space.kts

@@ -4,15 +4,15 @@ job("Deploy") {
     }
 
     container(image = "gradle:jdk17-alpine") {
-        env["SPC_HOST"] = Params("spc-host")
+        env["SPC_HOST"] = "{{ project:spc-host }}"
-        env["SPC_USER"] = Secrets("spc-webmaster-user")
+        env["SPC_USER"] = "{{ project:spc-webmaster-user }}"
-        env["SPC_ID"] = Secrets("spc-webmaster-id")
+        env["SPC_ID"] = "{{ project:spc-webmaster-id }}"
         kotlinScript { api ->
             api.space().projects.automation.deployments.start(
             	project = api.projectIdentifier(),
             	targetIdentifier = TargetIdentifier.Key("spc-site"),
             	version = "current",
-            	// automatically update deployment status based on a status of a job
+            	// automatically update deployment status based on the status of the job
             	syncWithAutomationJob = true
         	)
             api.gradle("uploadDistribution")
@@ -26,9 +26,9 @@ job("Restart service"){
     }
 
     container(image = "gradle:jdk17-alpine") {
-        env["SPC_HOST"] = Params("spc-host")
+        env["SPC_HOST"] = "{{ project:spc-host }}"
-        env["SPC_USER"] = Secrets("spc-webmaster-user")
+        env["SPC_USER"] = "{{ project:spc-webmaster-user }}"
-        env["SPC_ID"] = Secrets("spc-webmaster-id")
+        env["SPC_ID"] = "{{ project:spc-webmaster-id }}"
         kotlinScript { api ->
             api.gradle("reloadDistribution")
         }

build.gradle.kts

@@ -52,22 +52,23 @@ apiValidation{
 
 val host = System.getenv("SPC_HOST")
 val user = System.getenv("SPC_USER")
-//val password = System.getenv("SPC_PASSWORD")
+val password = System.getenv("SPC_PASSWORD")
-val identityString = System.getenv("SPC_ID")
+val privateKey = System.getenv("SPC_ID")
+//val publicKey = System.getenv("SPC_PUBKEY")
 val serviceName = "sciprog-site"
 
-if (host != null && user != null || identityString != null) {
+if (host != null && user != null || privateKey != null) {
     val uploadDistribution by tasks.creating {
         group = "distribution"
         dependsOn("installDist")
         doLast {
             JSch {
-                addIdentity("spc-webmaster", identityString.encodeToByteArray(), null, null)
+                addIdentity("webmaster", privateKey.encodeToByteArray(), null, null)
             }.useSession(host, user) {
                 //stopping service during the upload
                 execute("sudo systemctl stop $serviceName")
                 uploadDirectory(buildDir.resolve("install/spc-site"), "/opt")
-                //adding executable flag to the entry point
+                //adding an executable flag to the entry point
                 execute("sudo chmod +x /opt/spc-site/bin/spc-site")
                 execute("sudo systemctl start $serviceName")
             }
@@ -78,7 +79,7 @@ if (host != null && user != null || identityString != null) {
         group = "distribution"
         doLast {
             JSch {
-                addIdentity("spc-webmaster", identityString.encodeToByteArray(), null, null)
+                addIdentity("webmaster", privateKey.encodeToByteArray(), null, null)
             }.useSession(host, user) {
                 execute("sudo systemctl restart $serviceName")
             }

data/magprog/content/mentors/Gorbachev.md

@@ -0,0 +1,35 @@
+---
+content_type: magprog_mentor
+name: Алексей Юрьевич Горбачев
+id: Gorbachev
+image: images/mentors/Gorbachev.jpg
+language: ru
+---
+
+#### Организация
+Заведующий лабораторией протеомного анализа ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России.
+
+#### Биография
+* Победитель Всероссийской олимпиады по биологии (Диплом III степени, 2004).
+* Обучение в МГУ им. М.В. Ломоносова, биологический факультет, кафедра молекулярной биологии (2004-2009).
+* Обучение в аспирантуре ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по специальности Биохимия (2009-2012).
+* Защита кандидатской диссертации (2014).
+* Руководство проектом "Разработка системы генетического скрининга
+сердечно-сосудистых заболеваний" в рамках программы трансляционных исследований и инноваций Сколковского Института Науки и Технологий при сотрудничестве с РЖД (2015-2016).
+* Коммерческая деятельность в рамках собственной научно-исследовательской компании "Институт геномного анализа", создание проекта Zenome (2016-н.в.)
+* Научная деятельность в ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России в должности заведующего лабораторий протеомного анализа (2022-н.в.)
+
+#### Направление исследований
+
+* Изучение механизмов долговременной эпигенетической памяти у адгезивно-инвазивных форм кишечной палочки (E. coli), ассоциированной с болезнью Крона.
+* Исследование репертуаров T-клеточных рецепторов у пациентов с болезнью Крона.
+* Протеогеномное профилирование образцов рака молочной железы как основа для разработки платформы прототипирования персонализированных панелей для тераностики.
+* Разработка новых методов диагностики рака с помощью секвенирования свободной циркулирующей ДНК плазмы крови.
+
+#### Требования к студентам
+
+* Знание языков программирования: Python, R, bash.
+* Умение работать с Git.
+* Английский язык на уровне чтения технической документации.
+* Знание ОС Linux и Windows на уровне опытного пользователя.
+* Знания биохимии и молекулярной биологии на уровне университетской программы.

data/magprog/content/mentors/Gorbachev[info].md

@@ -0,0 +1,3 @@
+**Заведующий лабораторией протеомного анализа ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России.**
+
+Ключевые слова: *Био-информатика, протеомный анализ, диагностика рака*.

src/main/kotlin/center/sciprog/spcHome.kt

@@ -110,23 +110,23 @@ context(WebPage) private fun HTML.spcHomePage() {
             // Main
             div {
                 id = "main"
-                section {
+//                section {
-                    div("inner home_creationinfo") {
+//                    div("inner home_creationinfo") {
-                        a(href = "https://mipt.ru/education/departments/fpmi/") {
+//                        a(href = "https://mipt.ru/education/departments/fpmi/") {
-                            span("image") {
+//                            span("image") {
-                                img {
+//                                img {
-                                    src = "images/FPMI.jpg"
+//                                    src = "images/FPMI.jpg"
-                                    alt = "FPMI"
+//                                    alt = "FPMI"
-                                    height = "60dp"
+//                                    height = "60dp"
-                                    width = "60dp"
+//                                    width = "60dp"
-                                }
+//                                }
-                            }
+//                            }
-                        }
+//                        }
-                        p {
+//                        p {
-                            +"Centre was created in 2022 based on the Phystech School of Applied Mathematics and Informatics at MIPT"
+//                            +"Centre was created in 2022 based on the Phystech School of Applied Mathematics and Informatics at MIPT"
-                        }
+//                        }
-                    }
+//                    }
-                }
+//                }
 
                 section {
                     div("inner") {