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645bf5eea4
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9c5116316a
@ -10,7 +10,7 @@ description = """The main head of all numass projects"""
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dependencies {
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dependencies {
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compile group: 'commons-cli', name: 'commons-cli', version:'1.+'
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compile group: 'commons-cli', name: 'commons-cli', version:'1.+'
|
||||||
compile group: 'commons-io', name: 'commons-io', version:'2.+'
|
compile group: 'commons-io', name: 'commons-io', version:'2.+'
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compile project(':dataforge-fitting:dataforge-minuit')
|
compile project(':dataforge-stat:dataforge-minuit')
|
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compile project(':dataforge-fx')
|
compile project(':dataforge-fx')
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compile project(':dataforge-plots')
|
compile project(':dataforge-plots')
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compile project(':numass-storage')
|
compile project(':numass-storage')
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@ -17,8 +17,8 @@ package hep.dataforge.plotfit;
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import hep.dataforge.actions.OneToOneAction;
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import hep.dataforge.actions.OneToOneAction;
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||||||
import hep.dataforge.context.Context;
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.FitState;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitState;
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import hep.dataforge.fitting.models.XYModel;
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import hep.dataforge.stat.models.XYModel;
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||||||
import hep.dataforge.description.NodeDef;
|
import hep.dataforge.description.NodeDef;
|
||||||
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
||||||
import hep.dataforge.description.ValueDef;
|
import hep.dataforge.description.ValueDef;
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||||||
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@ -20,7 +20,7 @@ import hep.dataforge.context.Context;
|
|||||||
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
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||||||
import static hep.dataforge.context.GlobalContext.out;
|
import static hep.dataforge.context.GlobalContext.out;
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||||||
import hep.dataforge.data.FileDataFactory;
|
import hep.dataforge.data.FileDataFactory;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.MINUITPlugin;
|
import hep.dataforge.stat.fit.MINUITPlugin;
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||||||
import hep.dataforge.io.IOManager;
|
import hep.dataforge.io.IOManager;
|
||||||
import hep.dataforge.io.MetaFileReader;
|
import hep.dataforge.io.MetaFileReader;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
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@ -19,11 +19,11 @@ import hep.dataforge.actions.ActionManager;
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|||||||
import hep.dataforge.context.BasicPlugin;
|
import hep.dataforge.context.BasicPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.context.Context;
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
import hep.dataforge.context.PluginDef;
|
import hep.dataforge.context.PluginDef;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.FitManager;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitManager;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.FitPlugin;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.models.ModelManager;
|
import hep.dataforge.stat.models.ModelManager;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.models.WeightedXYModel;
|
import hep.dataforge.stat.models.WeightedXYModel;
|
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import hep.dataforge.fitting.models.XYModel;
|
import hep.dataforge.stat.models.XYModel;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
import hep.dataforge.plotfit.PlotFitResultAction;
|
import hep.dataforge.plotfit.PlotFitResultAction;
|
||||||
|
@ -16,11 +16,11 @@
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|||||||
package inr.numass.actions;
|
package inr.numass.actions;
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||||||
import hep.dataforge.actions.OneToOneAction;
|
import hep.dataforge.actions.OneToOneAction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.FitState;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitState;
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||||||
import hep.dataforge.fitting.FitTaskResult;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitTaskResult;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.Param;
|
import hep.dataforge.stat.fit.Param;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.ParamSet;
|
import hep.dataforge.stat.fit.ParamSet;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.models.Histogram;
|
import hep.dataforge.stat.models.Histogram;
|
||||||
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
||||||
import hep.dataforge.io.ColumnedDataWriter;
|
import hep.dataforge.io.ColumnedDataWriter;
|
||||||
import hep.dataforge.io.PrintFunction;
|
import hep.dataforge.io.PrintFunction;
|
||||||
@ -34,7 +34,7 @@ import hep.dataforge.plots.PlotsPlugin;
|
|||||||
import hep.dataforge.plots.XYPlotFrame;
|
import hep.dataforge.plots.XYPlotFrame;
|
||||||
import hep.dataforge.plots.data.PlottableData;
|
import hep.dataforge.plots.data.PlottableData;
|
||||||
import hep.dataforge.plots.data.PlottableXYFunction;
|
import hep.dataforge.plots.data.PlottableXYFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.generators.GaussianParameterGenerator;
|
import hep.dataforge.stat.simulation.GaussianParameterGenerator;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.ListTable;
|
import hep.dataforge.tables.ListTable;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.MapPoint;
|
import hep.dataforge.tables.MapPoint;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.Table;
|
import hep.dataforge.tables.Table;
|
||||||
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@ -19,7 +19,7 @@ import hep.dataforge.actions.GroupBuilder;
|
|||||||
import hep.dataforge.actions.ManyToOneAction;
|
import hep.dataforge.actions.ManyToOneAction;
|
||||||
import hep.dataforge.context.Context;
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
import hep.dataforge.data.DataNode;
|
import hep.dataforge.data.DataNode;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.FitState;
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitState;
|
||||||
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
import hep.dataforge.description.TypedActionDef;
|
||||||
import hep.dataforge.io.ColumnedDataWriter;
|
import hep.dataforge.io.ColumnedDataWriter;
|
||||||
import hep.dataforge.io.reports.Reportable;
|
import hep.dataforge.io.reports.Reportable;
|
||||||
|
@ -15,9 +15,9 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.data;
|
package inr.numass.data;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.fitting.ParamSet;
|
import hep.dataforge.stat.fit.ParamSet;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.models.Generator;
|
import hep.dataforge.stat.models.Generator;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.models.XYModel;
|
import hep.dataforge.stat.models.XYModel;
|
||||||
import static hep.dataforge.maths.RandomUtils.getDefaultRandomGenerator;
|
import static hep.dataforge.maths.RandomUtils.getDefaultRandomGenerator;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.DataPoint;
|
import hep.dataforge.tables.DataPoint;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.ListTable;
|
import hep.dataforge.tables.ListTable;
|
||||||
|
@ -15,7 +15,7 @@
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|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.data;
|
package inr.numass.data;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import static hep.dataforge.maths.MatrixOperations.inverse;
|
import static hep.dataforge.maths.MatrixOperations.inverse;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.NamedMatrix;
|
import hep.dataforge.maths.NamedMatrix;
|
||||||
import hep.dataforge.tables.DataPoint;
|
import hep.dataforge.tables.DataPoint;
|
||||||
|
@ -16,7 +16,7 @@
|
|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
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||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
import java.io.File;
|
import java.io.File;
|
||||||
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@ -5,7 +5,7 @@
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*/
|
*/
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||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
||||||
import inr.numass.Numass;
|
import inr.numass.Numass;
|
||||||
|
@ -17,7 +17,7 @@ package inr.numass.models;
|
|||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.exceptions.NamingException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NamingException;
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.GaussRuleIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.GaussRuleIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
|
@ -16,8 +16,8 @@
|
|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
import org.apache.commons.math3.analysis.BivariateFunction;
|
import org.apache.commons.math3.analysis.BivariateFunction;
|
||||||
|
@ -17,8 +17,8 @@ package inr.numass.models;
|
|||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NameNotFoundException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NameNotFoundException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import static hep.dataforge.names.NamedUtils.combineNamesWithEquals;
|
import static hep.dataforge.names.NamedUtils.combineNamesWithEquals;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
|
@ -16,7 +16,7 @@
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|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
import static java.lang.Math.exp;
|
import static java.lang.Math.exp;
|
||||||
|
@ -16,7 +16,7 @@
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|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
||||||
|
@ -15,7 +15,7 @@
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*/
|
*/
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||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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import hep.dataforge.fitting.parametric.FunctionCaching;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.FunctionCaching;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.GaussRuleIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.GaussRuleIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.plots.XYPlotFrame;
|
import hep.dataforge.plots.XYPlotFrame;
|
||||||
|
@ -15,8 +15,8 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.names.NamedUtils;
|
import hep.dataforge.names.NamedUtils;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
|
@ -15,8 +15,8 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import static hep.dataforge.names.NamedUtils.combineNamesWithEquals;
|
import static hep.dataforge.names.NamedUtils.combineNamesWithEquals;
|
||||||
import hep.dataforge.utils.MultiCounter;
|
import hep.dataforge.utils.MultiCounter;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
|
@ -15,10 +15,10 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import static hep.dataforge.fitting.parametric.FunctionUtils.getSpectrumDerivativeFunction;
|
import static hep.dataforge.stat.parametric.FunctionUtils.getSpectrumDerivativeFunction;
|
||||||
import static hep.dataforge.fitting.parametric.FunctionUtils.getSpectrumFunction;
|
import static hep.dataforge.stat.parametric.FunctionUtils.getSpectrumFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.MathUtils;
|
import hep.dataforge.maths.MathUtils;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.NamedVector;
|
import hep.dataforge.maths.NamedVector;
|
||||||
import hep.dataforge.names.AbstractNamedSet;
|
import hep.dataforge.names.AbstractNamedSet;
|
||||||
|
@ -15,7 +15,7 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
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||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
|
|
||||||
/**
|
/**
|
||||||
*
|
*
|
||||||
|
@ -16,7 +16,7 @@
|
|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.names.NameSetContainer;
|
import hep.dataforge.names.NameSetContainer;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
|
@ -15,8 +15,8 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
import inr.numass.NumassIntegrator;
|
||||||
import inr.numass.Numass;
|
import inr.numass.Numass;
|
||||||
|
@ -15,7 +15,7 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.NamedVector;
|
import hep.dataforge.maths.NamedVector;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import static java.lang.Math.abs;
|
import static java.lang.Math.abs;
|
||||||
|
@ -16,8 +16,8 @@
|
|||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
import hep.dataforge.values.ValueProvider;
|
||||||
|
@ -6,7 +6,7 @@
|
|||||||
package inr.numass.models.sterile;
|
package inr.numass.models.sterile;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import static java.lang.Math.abs;
|
import static java.lang.Math.abs;
|
||||||
import static java.lang.Math.exp;
|
import static java.lang.Math.exp;
|
||||||
|
@ -5,7 +5,7 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models.sterile;
|
package inr.numass.models.sterile;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
import inr.numass.models.ResolutionFunction;
|
import inr.numass.models.ResolutionFunction;
|
||||||
|
@ -6,7 +6,7 @@
|
|||||||
package inr.numass.models.sterile;
|
package inr.numass.models.sterile;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.context.Context;
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
|
@ -10,9 +10,9 @@ import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
|||||||
import hep.dataforge.description.NodeDef;
|
import hep.dataforge.description.NodeDef;
|
||||||
import hep.dataforge.description.ValueDef;
|
import hep.dataforge.description.ValueDef;
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NotDefinedException;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricBiFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.AbstractParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.AbstractParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricBiFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricBiFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
import hep.dataforge.maths.integration.UnivariateIntegrator;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
import hep.dataforge.values.NamedValueSet;
|
||||||
|
@ -6,8 +6,8 @@
|
|||||||
package inr.numass.models.sterile;
|
package inr.numass.models.sterile;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.context.Context;
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.ParamSet;
|
import hep.dataforge.stat.fit.ParamSet;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.parametric.ParametricFunction;
|
import hep.dataforge.stat.parametric.ParametricFunction;
|
||||||
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
import hep.dataforge.maths.MathPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
import hep.dataforge.meta.MetaBuilder;
|
import hep.dataforge.meta.MetaBuilder;
|
||||||
|
@ -0,0 +1,69 @@
|
|||||||
|
/*
|
||||||
|
* To change this license header, choose License Headers in Project Properties.
|
||||||
|
* To change this template file, choose Tools | Templates
|
||||||
|
* and open the template in the editor.
|
||||||
|
*/
|
||||||
|
package inr.numass.tasks;
|
||||||
|
|
||||||
|
import hep.dataforge.actions.Action;
|
||||||
|
import hep.dataforge.computation.WorkManager;
|
||||||
|
import hep.dataforge.context.Context;
|
||||||
|
import hep.dataforge.data.DataNode;
|
||||||
|
import hep.dataforge.data.DataSet;
|
||||||
|
import hep.dataforge.data.DataTree;
|
||||||
|
import hep.dataforge.meta.Meta;
|
||||||
|
import hep.dataforge.meta.MetaBuilder;
|
||||||
|
import hep.dataforge.meta.MetaUtils;
|
||||||
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitAction;
|
||||||
|
import hep.dataforge.stat.fit.FitState;
|
||||||
|
import hep.dataforge.tables.Table;
|
||||||
|
import hep.dataforge.values.Value;
|
||||||
|
import hep.dataforge.workspace.GenericTask;
|
||||||
|
import hep.dataforge.workspace.TaskModel;
|
||||||
|
import hep.dataforge.workspace.TaskState;
|
||||||
|
|
||||||
|
/**
|
||||||
|
*
|
||||||
|
* @author Alexander Nozik
|
||||||
|
*/
|
||||||
|
public class NumassFitScanTask extends GenericTask {
|
||||||
|
|
||||||
|
@Override
|
||||||
|
protected TaskState transform(WorkManager.Callback callback, Context context, TaskState state, Meta config) {
|
||||||
|
String scanParameter = config.getString("scanPar", "msterile2");
|
||||||
|
Value scanValues = config.getValue("scanValues", Value.of(new String[]{"0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3"}));
|
||||||
|
Action action = new FitAction().withContext(context).withParentProcess(callback.workName());
|
||||||
|
DataTree.Builder resultBuilder = DataTree.builder(FitState.class);
|
||||||
|
state.getData().forEachWithType(Table.class, (name, data) -> {
|
||||||
|
DataNode res = scanValues.listValue().stream().parallel().map(val -> {
|
||||||
|
MetaBuilder overrideMeta = new MetaBuilder("override");
|
||||||
|
overrideMeta.setValue("@resultName", String.format("%s[%s=%s]", name, scanParameter, val.stringValue()));
|
||||||
|
MetaBuilder paramMeta = MetaUtils.findNodeByValue(config, "params.param", name, scanParameter).getBuilder()
|
||||||
|
.setValue("value", val);
|
||||||
|
overrideMeta.setNode("params.param", paramMeta);
|
||||||
|
return action.run(DataNode.of(name, data, overrideMeta), config);
|
||||||
|
}).collect(
|
||||||
|
() -> DataSet.builder(FitState.class),
|
||||||
|
(DataSet.Builder builder, DataNode node) -> builder.putData(node.getName(), node.getData()),
|
||||||
|
(DataSet.Builder builder1, DataSet.Builder builder2) -> builder1.putAll(builder2.getDataMap())
|
||||||
|
).build();
|
||||||
|
resultBuilder.putNode(name, res);
|
||||||
|
});
|
||||||
|
|
||||||
|
state.finish(resultBuilder.build());
|
||||||
|
return state;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@Override
|
||||||
|
protected TaskModel transformModel(TaskModel model) {
|
||||||
|
//Transmit meta as-is
|
||||||
|
model.dependsOn("numass.prepare", model.meta());
|
||||||
|
return model;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@Override
|
||||||
|
public String getName() {
|
||||||
|
return "numass.fitscan";
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
@ -22,10 +22,11 @@ import inr.numass.actions.ReadNumassStorageAction;
|
|||||||
import inr.numass.storage.NumassData;
|
import inr.numass.storage.NumassData;
|
||||||
|
|
||||||
/**
|
/**
|
||||||
*
|
* Prepare data task
|
||||||
|
*
|
||||||
* @author Alexander Nozik
|
* @author Alexander Nozik
|
||||||
*/
|
*/
|
||||||
public class PrepareTask extends GenericTask {
|
public class NumassPrepareTask extends GenericTask {
|
||||||
|
|
||||||
/*
|
/*
|
||||||
<action type="readStorage" uri="file://D:\Work\Numass\data\2016_04\T2_data\">
|
<action type="readStorage" uri="file://D:\Work\Numass\data\2016_04\T2_data\">
|
@ -37,7 +37,11 @@ public class Workbench extends Application {
|
|||||||
primaryStage.show();
|
primaryStage.show();
|
||||||
|
|
||||||
scene.getWindow().setOnCloseRequest((WindowEvent event) -> {
|
scene.getWindow().setOnCloseRequest((WindowEvent event) -> {
|
||||||
controller.getContext().workManager().getRoot().cancel(true);
|
try {
|
||||||
|
controller.getContext().workManager().getRoot().cancel(true);
|
||||||
|
} catch (Exception e) {
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
});
|
});
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
@ -46,9 +50,7 @@ public class Workbench extends Application {
|
|||||||
GlobalContext.instance().close();
|
GlobalContext.instance().close();
|
||||||
super.stop();
|
super.stop();
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
/**
|
/**
|
||||||
* @param args the command line arguments
|
* @param args the command line arguments
|
||||||
*/
|
*/
|
||||||
|
@ -15,7 +15,7 @@
|
|||||||
*/
|
*/
|
||||||
package inr.numass.models;
|
package inr.numass.models;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.ParamSet;
|
import hep.dataforge.stat.fit.ParamSet;
|
||||||
import hep.dataforge.plots.fx.FXPlotUtils;
|
import hep.dataforge.plots.fx.FXPlotUtils;
|
||||||
|
|
||||||
/**
|
/**
|
||||||
|
@ -16,8 +16,8 @@
|
|||||||
package inr.numass.run;
|
package inr.numass.run;
|
||||||
|
|
||||||
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
import hep.dataforge.context.GlobalContext;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.MINUITPlugin;
|
import hep.dataforge.stat.fit.MINUITPlugin;
|
||||||
import hep.dataforge.fitting.ParamSet;
|
import hep.dataforge.stat.fit.ParamSet;
|
||||||
import hep.dataforge.exceptions.NamingException;
|
import hep.dataforge.exceptions.NamingException;
|
||||||
import inr.numass.models.BetaSpectrum;
|
import inr.numass.models.BetaSpectrum;
|
||||||
import inr.numass.models.ModularSpectrum;
|
import inr.numass.models.ModularSpectrum;
|
||||||
|
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